拆除工作台需要使用镐类工具，包括普通镐、钻头或钻头控制装置。首先将镐子放入快捷栏并选中，激活智能光标后将光标移动到工作台上，点击攻击按钮即可拆除。拆除后的工作台若距离较近会自动收入背包，这是最基础的拆除方法。工作台属于方块类道具，必须使用镐子才能有效拆除，其他工具如锤子无法对其产生效果。
拆除工作台前需要确认已拥有合适的工具，最低级的木镐即可完成操作但效率较低。对于移动版玩家，需注意右侧摇杆的操作方式，先点击智能光标图标再移动光标定位。PC版则直接使用鼠标控制光标位置。拆除过程中若遇到障碍物阻挡，可能需要调整站位或先清理周边环境。工作台拆除后不会消耗任何材料，可以随时重新放置使用，这为建筑改造提供了便利。
除了常规镐子拆除外，爆炸物也能用于拆除工作台，但这种方法不够精确且会破坏周围方块。使用爆炸物时需确保其能炸毁物块，将爆炸物放置在工作台边缘引爆即可。这种方法适合需要快速清理大片区域的情况，但会损失工作台掉落的材料。相比之下，镐子拆除更为精准可控，是推荐的主要拆除方式。
拆除工作台时还需注意环境因素，若工作台放置在特定背景墙前，可能需要先处理墙面。天然生成的工作台较为罕见，其拆除方式与玩家放置的相同。在多人只有放置工作台的玩家或拥有修改权限的玩家才能进行拆除操作。拆除后若未自动拾取，需要手动靠近掉落物才能回收。
