请诸葛亮出山辅佐，是早期一个关键且必须遵循特定步骤的剧情。这个过程自然融入主线，你只需要故事推进耐心拜访即可。游戏初期你帮助刘表解决了荆州附近的黄巾余党后，会获得新野城作为据点，之后刘琦会来报信，告知刘表病危，前往荆州城探望刘表后，会触发蔡瑁迫害的剧情，你将从宫殿的密道逃出，这条密道直接通往水镜庄。在那里，你从水镜先生口中第一次正式得知了卧龙诸葛亮的消息和他隐居的卧龙岗所在地，这是寻找他的第一步。
得知诸葛亮的大致方位后，你需要前往地图东北方向的卧龙岗，那里有一座紫色屋顶的茅庐。但首次拜访通常会扑空，门口的书童会告诉你先生外出闲游去了。这时你别无选择，只能先返回新野城。回城后，城内的伊籍会报告曹军来袭的消息，你不得不先去新野城西边的博望坡迎战曹军，这是剧情安排的一次小考验。打完仗回来，你可能会想着再去试试，但第二次前往卧龙岗，很可能依然见不到诸葛亮本人，书童或许会给出类似的答复，这意味着时机仍未成熟。
你需要再次回到荆州城与奄奄一息的刘表对话，之后返回新野游戏里可能会安排一场雨景或其他情节暗示。坚持前往卧龙岗，这次你会发现诸葛亮正在家中午睡。游戏会弹出选项，询问你是否要打扰他，这里有一个流传甚广的小窍门：不要急着按键选择是。如果你急切地选择是，可能会反复触发诸葛亮未醒的对话，导致流程卡住。正确的方法是等待几秒钟，或者直接选择否，诸葛亮便会自然醒来。与他对话后，他就会正式加入你的队伍，成为军中至关重要的军师。
诸葛亮加入后，会对队伍实力产生质的飞跃。他不仅拥有极高的智力属性，能使用强力的计策，而且其作为军师的计策点（MP）恢复速度也很快。在后续的赤壁之战等重大剧情中，诸葛亮更是关键人物，例如需要使用特定的秘法书来改变风向，这本书必须由他装备并使用。成功请他出山后，要记得及时在菜单中设置他为军师，并把重要的计策书交给他。他的加入标志着游戏主线进入了一个全新的阶段，后续的冒险和战略都将围绕他的智谋展开。
