在前期开荒阶段，副武器的选择至关重要，它能在主武器弹药不足或应对特殊敌人时提供关键的火力补充。对于新手指挥官而言，苦无、赤毒努克微波、虚空利刃、念力炮和磁力枪等都是性价比较高的热门选择。这些武器普遍具有获取难度低、操作简单且能有效提升前期战斗体验的特点，能够帮助你更顺畅地度过游戏初始阶段。
苦无作为基础的投掷类副武器，虽然面板伤害不算突出，但其射速快、装填速度快，在近距离对付成群的小型敌人时效率很高，而且制作蓝图和所需材料在前期很容易获得。赤毒努克微波则是一种射线类武器，能持续对敌人造成伤害并附加异常状态，对付护甲厚的敌人效果不错，不过需要注意它的暴击率相对较低。虚空利刃的设计比较独特，可以灵活地在远程射击与近战劈砍模式间切换，适合喜欢多变战斗风格的玩家，但其远程模式下的弹药消耗较快。这些武器的设计图通常可以通过完成游戏内的初期任务、在商店用游戏内货币购买蓝图，或是击败特定敌人来获取。
拿到称手的副武器后，合理的MOD配置能让其威力显著提升。前期应优先安装能够直接增加武器基础伤害的MOD，例如副武器对应的黄蜂蛰刺。积极收集并搭配冰、火、电、毒这几种基础元素MOD来组合成腐蚀或辐射等复合伤害属性，可以有效针对前期星球上不同护甲类型的敌人。副武器的强化思路应专注于提升其核心功能，例如对于苦无这样可以快速触发的武器，可以侧重提升触发几率；而对于磁力枪这类有穿透能力的武器，则适合强化其稳定性和射程。在资源有限的前期，不建议过早进行极化操作，应集中资源先将一两把主力副武器培养起来。
选择副武器时，还需要考虑它与你使用的主武器及战甲技能的互补性。如果你的主武器擅长远程单体狙击，那么副武器可以选择苦无或赤毒努克微波来应对近距离的突发状况或处理群体敌人。副武器的定位更多是功能性补充和应急，因此在开荒期不必过分追求极致的伤害数值，可靠实用、节约弹药才是关键。游戏进程推进和段位提升，你可以逐步接触到来自氏族道场实验室或特定活动提供的更多副武器蓝图，从而拥有更广阔的选择空间。
