主线任务是引导玩家体验游戏流程和了解游戏故事的核心，它始于祖父那封充满期待的信件，引导玩家接手破败的农场并融入星露谷的生活。游戏的主线推进主要围绕两个核心选择展开：修复社区中心或加入Joja超市。社区中心的修复是经典的剧情路径，通过收集各种物品完成不同房间的献祭来逐步恢复小镇的活力；而Joja超市路线则提供了通过支付金钱直接解锁设施的另一种可能性，这条路线更直接高效，但会错过献祭特有的剧情互动。无论选择哪条道路，最终都能达成复兴小镇的目标，但旅途中的体验与收获有所不同，你的选择定义了属于你的星露谷故事。
主线任务的触发机制与玩家的日常活动、村民关系以及探索行为紧密相关，并没有严格的先后顺序。在玩家入村的前两周内，一系列主线任务会通过邮件或与关键NPC（如镇长刘易斯）的对话自然出现，这些任务帮助玩家熟悉种植、采矿等基本操作。后续任务的触发则依赖于游戏进度的推进，例如镇长可能会给你矿山探险的任务，这便是一个重要的剧情节点。与村民保持良好的关系至关重要，提升好感度后，不仅能在公告栏看到更高级别的求助任务，某些关键NPC（如法师）也会在关系达到一定程度后给予你推动核心剧情的特殊任务。参加季节性的节日活动也是触发和推进主线剧情的重要方式之一。
游戏中期之后，更深层的主线剧情，特别是涉及法师与女巫的任务链，其触发有明确的前置条件。无论是选择社区中心献祭路线还是Joja超市捐款路线，都必须将所选路线的主线剧情彻底完成，即完成所有的献祭任务包或支付所有必要的款项。完成这一核心主线后，前往火车站的场景便会自动触发巫师的相关剧情，从而开启寻找黑暗护符的新任务线。要完成女巫任务，还需要解锁下水道并与其中的居民科罗布斯对话，以解除突变虫穴的屏障，取得关键道具后才能进入女巫沼泽，最终获取魔法墨水并交还给巫师。
虽然主线任务本身没有严格的时间限制，玩家可以按照自己的节奏进行，但合理的规划能极大提升游戏体验的效率。部分任务内容具有季节性，例如特定作物或鱼类的收集只能在某个季节完成，如果错过就需要等待来年，因此需要玩家留意季节更替并提前规划。在资源准备方面，对于需要硬木、稀有矿石等材料的任务，建议提前进行积累。当同时推进多个任务时，可以优先完成那些能够解锁新功能或新区域的任务，例如修复矿车以快速移动，或修复威利的船只以开通前往姜岛的航线，这些都能为后续的冒险提供巨大便利。
