变化洞窟的正常通关过程很简单，因为其内部没有任何复杂的迷宫或特殊剧情需要完成。这个位于六之岛的洞窟，在玩家通关一周目后的二周目内容中才能进入，其内部的布局是固定的单层洞穴，没有向上或向下的分支路线，因此不存在传统意义上的迷宫走法难题。玩家进入后可以直接走到洞穴深处，整个过程除了遭遇野生宝可梦外，没有解谜机关或需要特定技能才能障碍。
要找到并进入变化洞窟，你需要先完成游戏的主线剧情进入二周目，并前往七岛地区的六之岛。具体的路线是，到达六之岛后，在去往洞穴路上的岔路口一直向上走，接着再一直向左移动，穿过一片栖息着虫系宝可梦的森林区域。你需要一直向北方向使用冲浪术渡海，在海面上会遇到一个火箭队的小兵，而他上方的那个洞穴入口就是变化洞窟。找到位置后直接进入即可，洞口没有任何进入条件限制。
这个洞窟之所以令人困惑，是因为它在游戏设计上是一个未完全启用的特殊地点。按照最初的计划，这里本应是一个可以通过官方配信的神秘礼物来改变内部出现宝可梦种类的动态洞穴，甚至曾有设计让玩家输入宝可梦名字来定向遇到特定宝可梦的彩蛋。但这些功能在游戏正式发行后被取消了。在未借助任何外部配信事件的常规游戏进程中，变化洞窟内部出现的野生宝可梦只有超音蝠，并没有其他稀有宝可梦，这也解释了为什么许多玩家探索后会觉得里面空无一物。
关于探索的准备工作，由于洞内只有超音蝠，且其等级不会特别高，所以你不需要为此专门调整队伍或携带大量特定的道具。为了应付普通的野外战斗，带上一些精灵球和基础的恢复药品如伤药或解毒药就足够了。队伍中如果有一只学会闪光术的宝可梦，可以让洞窟内变得明亮，但这不是必需的，因为洞穴结构本身并不复杂。你的主要目的可能就是完成图鉴记录，抓获一只超音蝠，或者仅仅是探索地图上的每一个地点。
